OBJECTIVE: To identify personal, institutional and contextual factors involved in the scientific papers production process by Medical School researchers. MATERIAL AND METHODS: 1) The San Marcos University Research Activities Registry (RAIS) data base created by the Research Council (CSI); and 2) In depth interviews of intentionally selected informers inquiring about various aspects of the scientific production process. RESULTS: During the period 1990 through 2001 from 994 faculty members, 149 (15%) published scientific papers in journals and registered them in the RAIS. Their profile was: males 62%; mean age 58; physicians 2 out of 3; with Doctor or Master Degree and either exclusive dedication or full time faculty 1 of every 2; attached to Research Center/ Institute 60%. The interviews qualitative analysis highlighted the consensus that scientific studies results should be published, but requirement of minimal material and social conditions was not always satisfied by the university. CONCLUSIONS: Production of scientific papers varies among Medical School researchers, and various limiting factors were appreciated. The university should consider process pecularities and correct interferences by releasing specific norms. Objetivo: Identificar factores personales, institucionales y contextuales implicados en el proce- so de producción científica de los investigadores de la Facultad de Medicina. Material y métodos: 1) Base de datos del Registro de Actividades de Investigación de San Marcos (RAIS), creado por el Consejo Superior de Investigaciones (CSI); y 2) Entrevistas en profundidad de informantes intencionalmente seleccionados para indagar sobre diferentes aspectos de la publica- ción científica. Resultados: De un total de 994 profesores ordinarios de la Facultad de Medi- cina, 149 (15%) registraron en el CSI (RAIS) publicaciones en revistas de 1990-2001. Las características de los últimos fueron: varones, 62%; edad media 58 años; médicos 2 de cada 3, con grado de doctor o maestro y a dedicación exclusiva o tiempo completo 1 de cada 2; y, adscritos a Centro/Instituto de Investigación, 60%. El análisis cualitativo de las entrevistas destaca, en con- senso, que los resultados de la investigación deben ser publicados, para lo cual se requiere de condiciones materiales y sociales mínimas, no siempre satisfechas por la universidad. Conclusión: La producción de publicaciones científicas varía entre los investigadores; pero, en general, se aprecian diversos factores limitantes. La universidad debe considerar las particularidades de dicho proceso y corregir tales interferencias a través de normas específicas.