Para determinar la prevalencia de Entamoeba histolytica como productora de diarrea, se realizó un estudio en niños menores de cinco años con diarrea que asistieron a diversas consultas del Servicio Autónomo Hospital Universitario de Maracaibo, Venezuela. A las muestras de heces obtenidas, se les realizó examen macroscópico, microscópico con solución salina fisiológica 0,85% y lugol, así como coloración de Kinyoun. El resto de la muestra se congeló hasta la extracción del ADN y luego se amplificaron mediante PCR separadas para E. histolytica y E. dispar. De las 50 muestras analizadas mediante examen microscópico, ninguna presentó trofozoítos y/o quistes de Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii, ni coccidios intestinales. Los parásitos detectados fueron Giardia lamblia (6%), Blastocystis sp. (6%), Pentatrichomonas hominis (2%), Ascaris lumbricoides (2%) y Trichuris trichiura (2%). Mediante PCR, 6 muestras (12%) presentaron ADN de E. dispar y 2 (4%) ADN de E. histolytica. Ningún niño presentó asociación de ambas amibas. Los dos niños que presentaron E. histolytica tenían 1 año de edad. E. dispar si fue detectada en niños de menor edad. Se sugiere que la prevalencia de E. histolytica en niños menores de cinco años con diarrea es realmente baja. To determine the prevalence of Entamoeba histolytica as a producer of diarrhea, a study was conducted in children, less than five years of age, with diarrhea who attended several out patient clinics of the Servicio Autónomo Hospital Universitario, Maracaibo, Venezuela. A macroscopic and microscopic examination with physiological saline, lugol and Kinyoun staining were performed to the stool samples obtained. The remainder of the sample was frozen until DNA extraction, and PCR amplification was performed separately for E. histolytica and E. dispar. Microscopic examination showed no trophozoites and/or cysts of Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii, or intestinal coccidians in any of the 50 samples analyzed. Parasites detected were Giardia lamblia (6%), Blastocystis sp. (4%), Pentatrichomonas hominis (2%), Ascaris lumbricoides (2%) and Trichuris trichiura (2%). By PCR, six samples (12%) had DNA of E. dispar and two (4%) had DNA from E. histolytica; no child showed association of both amoebae. The two children who had E. histolytica were one-year-old. E. dispar was detected in younger children. We suggest that the prevalence of E. histolytica in children under five years is really low.