谷子组蛋白 H3 基因家族的鉴定与分析.
- Resource Type
- Article
- Authors
- 张晓霞; 李瑞淼; 张路瑶; 雷翠云; 杨宇琭; 杨致荣
- Source
- Journal of Shanxi Agricultural Sciences. 2023, Vol. 51 Issue 10, p1144-1152. 9p.
- Subject
- *GENE expression
*PLANT growth regulation
*FOXTAIL millet
*AMINO acid sequence
*CELL nuclei
*CHROMATIN
*CHROMOSOMES
- Language
- Chinese
- ISSN
- 1002-2481
组蛋白(Histone)是构成染色质的基本结构蛋白,其中组蛋白 H3 的氨基酸序列十分保守,并且其在维持 染色质结构稳定性、调控植物生长发育以及应对环境变化方面具有重要作用。为探究谷子组蛋白 H3 基因家族 成员的结构和功能,为谷子组蛋白 H3 的生物学功能研究奠定理论基础,研究从 xiaomi 和豫谷 1 号(YG1)基因组 中分别鉴定出 15 个组蛋白 H3 基因,并依次命名为 SiH3.1~SiH3.15;进而利用生物信息学技术比较并分析 SiH3 在染色体上的分布情况、系统进化关系、基因结构、保守基序、保守结构域、启动子顺式作用元件、亚细胞定位及 组织表达情况。结果表明,除 xiaomi 中的 SiH3.2 和 SiH3.13、YG1 中的 SiH3.10.1 和 SiH3.11.1 外,其他基因在染 色体的位置均一一对应。进化关系结果显示,SiH3 分属 4 类,其中,xiaomi 的 4 个类别中依次有 6、1、6、2 个基因, YG1 依次有 4、2、7、2 个基因;2 个品种亚组内基因间结构、保守基序、结构域相似,亚细胞定位均在细胞核;启动 子顺式作用元件主要与植物生长发育调控、逆境响应相关。表达模式结果显示,同属于 H3.3 亚组的 SiH3.7 和 SiH3.15 在不同组织中呈现组成型高表达,且在穗中表达量显著高于其他组织,说明二者在谷子全生育期,特别 是生殖生长阶段起到了重要作用,暗示其在谷子生产实践中具有重大的应用潜力。 [ABSTRACT FROM AUTHOR]