Introducción: La enfermedad de Crohn (EC) es un trastorno inflamatorio crónico transmural del tracto gastrointestinal de carácter desconocida. La desnutrición asociada con EC activa se ha reducido a pesar de la obesidad que ha aumentado. Se han propuesto estrategias dietéticas, como aquellos con alto contenido de proteínas para reducir la grasa corporal. Este estudio compara los efectos de dos suplementos sobre el estado nutricional de los pacientes con EC. Materiales y Métodos: Fueron randomizados en dos grupos 68 pacientes con EC: el grupo de proteína de suero y el grupo de proteína de soya. Se utilizo el análisis de bioimpedancia eléctrica, la antropometría y dosificaciones de albúmina y prealbúmina del estado nutricional midiéndose antes de comenzar la intervención y después de 8 y 16 semanas. La actividad de la enfermedad se determinó por Indice de Actividad de Enfermedad de Crohn (CDAI), dosificación en suero de la proteína C reactiva y la ingesta dietética por recordatorio de 24h. Resultados: Cuarenta y un pacientes concluyeron el estudio y ambos suplementos cambiaron la composición corporal de manera similar. El espesor del pliegue cutáneo del tríceps (p<0,001) y el porcentaje de grasa corporal (p = 0,001) se redujeron, mientras que la circunferencia muscular braquial (p = 0,004), el área muscular del brazo corregida (p = 0,005) y el porcentaje corporal magra (p = 0,001) han aumentado. Conclusiones: En los pacientes con enfermedad de Crohn sometidos con anti-TNF-alfa y terapias azatioprina, la suplementación con proteínas de suero de leche y de soya cambia la composición corporal a través de la reducción de la grasa corporal y por lo tanto contribuye para controlar la inflamación. [ABSTRACT FROM AUTHOR]