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1 . Academic Journal
teemi: An open-source literate programming approach for iterative design-build-test-learn cycles in bioengineering.
저자
by
Søren D Petersen
;
Lucas Levassor
;
Christine M Pedersen
;
Jan Madsen
;
Lea G Hansen
, et al.
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PLoS Computational Biology, Vol 20, Iss 3, p e1011929 (2024)
Open Access (DOAJ)
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7 . Academic Journal
Bottom-up parameterization of enzyme rate constants: Reconciling inconsistent data
저자
by
Daniel C. Zielinski
;
Marta R.A. Matos
;
James E. de Bree
;
Kevin Glass
;
Nikolaus Sonnenschein
, et al.
소스
Metabolic Engineering Communications, Vol 18, Iss , Pp e00234- (2024)
Full Text (ScienceDirect)
Full Text (ScienceDirect O/A)
Open Access (DOAJ)
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RefWorks
7 . Academic Journal
Probing efficient microbial CO2 utilisation through metabolic and process modelling
저자
by
Philip J. Gorter de Vries
;
Viviënne Mol
;
Nikolaus Sonnenschein
;
Torbjørn Ølshøj Jensen
;
Alex Toftgaard Nielsen
.
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Microbial Biotechnology, Vol 17, Iss 2, Pp n/a-n/a (2024)
Open Access (Wiley)
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7 . Academic Journal
Simultaneous application of enzyme and thermodynamic constraints to metabolic models using an updated Python implementation of GECKO
저자
by
Jorge Carrasco Muriel
;
Christopher Long
;
Nikolaus Sonnenschein
.
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Microbiology Spectrum, Vol 11, Iss 6 (2023)
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5 . Academic Journal
Reconstruction of a catalogue of genome-scale metabolic models with enzymatic constraints using GECKO 2.0
저자
by
Iván Domenzain
;
Benjamín Sánchez
;
Mihail Anton
;
Eduard J. Kerkhoven
;
Aarón Millán-Oropeza
, et al.
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Nature Communications, Vol 13, Iss 1, Pp 1-13 (2022)
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7 . Academic Journal
Whole-cell modeling in yeast predicts compartment-specific proteome constraints that drive metabolic strategies
저자
by
Ibrahim E. Elsemman
;
Angelica Rodriguez Prado
;
Pranas Grigaitis
;
Manuel Garcia Albornoz
;
Victoria Harman
, et al.
소스
Nature Communications, Vol 13, Iss 1, Pp 1-12 (2022)
Open Access (DOAJ)
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7 . Academic Journal
A consensus S. cerevisiae metabolic model Yeast8 and its ecosystem for comprehensively probing cellular metabolism
저자
by
Hongzhong Lu
;
Feiran Li
;
Benjamín J. Sánchez
;
Zhengming Zhu
;
Gang Li
, et al.
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Nature Communications, Vol 10, Iss 1, Pp 1-13 (2019)
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7 . Academic Journal
A Genome-Scale Metabolic Model of Methanoperedens nitroreducens: Assessing Bioenergetics and Thermodynamic Feasibility
저자
by
Bingqing He
;
Chen Cai
;
Tim McCubbin
;
Jorge Carrasco Muriel
;
Nikolaus Sonnenschein
, et al.
소스
Metabolites, Vol 12, Iss 314, p 314 (2022)
Open Access (DOAJ)
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7 . Academic Journal
Single-Cell Technologies to Understand the Mechanisms of Cellular Adaptation in Chemostats
저자
by
Naia Risager Wright
;
Nanna Petersen Rønnest
;
Nikolaus Sonnenschein
.
소스
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Vol 8 (2020)
Open Access (DOAJ)
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5 . Academic Journal
Integration of enzymatic data in Bacillus subtilis genome-scale metabolic model improves phenotype predictions and enables in silico design of poly-γ-glutamic acid production strains
저자
by
Ilaria Massaiu
;
Lorenzo Pasotti
;
Nikolaus Sonnenschein
;
Erlinda Rama
;
Matteo Cavaletti
, et al.
소스
Microbial Cell Factories, Vol 18, Iss 1, Pp 1-20 (2019)
Open Access (BioMed Central)
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