A fully automated touch-response behavior inspection pipeline on zebrafish larvae
- Resource Type
- research-article
- Authors
- Wang, Yanke; Pylatiuk, Christian; Mikut, Ralf; Peravali, Ravindra; Reischl, Markus
- Source
- at - Automatisierungstechnik. 71(10):845-852
- Subject
- experiments
full automation
object tracking
touch response
Vollautomation
Berührungsreizreaktionen
Objektverfolgung
Experimente
Applications
- Language
- English
- ISSN
- 0178-2312
2196-677X
Eine durch mechanische Berührungsreize ausgelöste Reaktion der Larven des Zebrabärblings liefert Informationen über den Mechanismus der genetischen funktionellen Expression. Kürzlich wurde ein automatisiertes System entwickelt, um genaue und wiederholte Berührungsreizreaktionsexperimente mit geringer menschlicher Assistenz durchzuführen. Zur Quantifizierung der gesammelten Daten schlagen wir eine vollautomatisierte Inspektionspipeline für Berührungsreizreaktionen von mehreren Larven vor, die auf Larventracking und Segmentierung basiert. Experimentelle Daten mit unterschiedlichen chemischen Behandlungen werden durch die vorgeschlagene Inspektionsplattform analysiert. Die Auswertung bestätigt, dass die Plattform vergleichbare Inspektionsanzeigen der Berührungsreizreaktionen effizient und automatisch erzeugen kann. Die ursprünglichen Ergebnisse wurden in einem Konferenzbeitrag beim 31. Workshop Computational Intelligence veröffentlicht und werden in diesem Artikel resümiert und erweitert.