利用多种分子标记鉴定西藏阿里牦牛生态类群遗传多样性状态,以期为阿里牦牛遗传资源的保护、开发和利用奠定理论基础.利用13个微卫星标记位点及线粒体D-Loop高变区分别对69头和50头西藏阿里牦牛进行了遗传多样性评估.结果显示,在13个微卫星位点中共检测出124个等位基因,其中TGL122和ILSTSO50位点的复等位基因数最多(15个),BGR3001位点的等位基因数最少(1个);从群体上来看,阿里牦牛群体的平均观测杂合度(Ho±SD)为0.5790±0.0139,其中11个位点偏离哈代-温伯格平衡,且近交系数(FIS)为0.192(P<0.05);虽然依据IAM和TPM模型暗示该群体存在显著瓶颈效应(P<0.05),但模式迁移图形仍为L-型分布;阿里牦牛线粒体D-loop区序列的794 bp片段范围内,共计鉴定到80个变异位点,同时构建得到38个单倍型,全部单倍型分为2个母系支系;群体平均单倍型多样性(Hd)为0.941,平均核苷酸多样性(Pi)为0.01600.说明目前阿里牦牛群体内仍具有较丰富的母系遗传多样性,但群体整体可能存在近交和经历瓶颈效应的风险,故而需要进一步加强该群体保种工作,同时优化或改变现有保种模式和方案.