为阐明间作栽培对作物生产力和土壤真菌群落组成及其多样性的影响机制,通过田间试验研究单作玉米(M)、单作大豆(S)和玉米||大豆(间作,MS)对作物干物质积累及产量的影响.利用高通量测序手段,分析不同处理土壤真菌群落组成及其多样性间的差异,阐明驱动土壤真菌群落组成及其多样性变化的土壤因子.结果表明:与单作相比,玉米||大豆提高了玉米干物质积累量,但降低了大豆干物质积累量,间作玉米具有产量优势.在玉米||大豆下,0~10 cm土层赤霉菌属(Gibberella)和核瑚菌属(Typhula)真菌为优势属,所占比例为40.75%~52.53%;粪锈伞科-未分类(Bolbitiaceae-U)、链格孢属(Alternaria)和枝孢属(Cladosporium)真菌在 11~20 cm土层为优势属,所占比例为34.65%~77.16%.与单作玉米相比,玉米||大豆降低了赤霉菌属、镰孢菌属(Fusarium)和核瑚菌属的相对丰度,显著提高了粪锈伞科-未分类的相对丰度.玉米||大豆下,随土层深度增加土壤真菌群落的ACE指数显著降低;与单作玉米相比,玉米||大豆极显著降低了 11~20 cm土层土壤真菌Chao1 和ACE指数.RDA分析表明,土壤总碳(TC)和碳氮比(C/N)是驱动0~10 cm土层土壤真菌群落组成及其Alpha多样性变化的主要因子;而在 11~20 cm土层,土壤真菌群落组成及其Alpha多样性的变化主要受土壤碱解氮(AN)的影响.间作提高了玉米生产力,影响了土壤真菌群落组成;TC、C/N和AN是引起土壤真菌群落组成及其Alpha多样性变化的主要因子.