Amaç: Çalışmada Giresun’a bağlı 5 ilçede yer alan 15 akarsu ve farklı 5 bölgedeki deniz suyunda protozoon ve helmintlerin varlığının gösterilmesi amaçlanmıştır. Yöntemler: Araştırma Mart 2012- Mayıs 2013 tarihleri arasında yapılmış olup her ay belirlenen tarihlerde su örnekleri toplanmıştır. Örnekler direk bakı ile incelendikten sonra kinyonun asit fast, modifiye trichrome ve trichrome boyaları ile boyanmıştır. Preparatlar ışık mikroskobunda parazitolojik açıdan değerlendirilmiştir. Bulgular: Örneklerin incelenmesi sonucunda Cryptosporidium spp. Cyclospora spp., Strongyloides türleri, Microsporidia, Blastocystis spp., kancalı kurt ve Giardia spp., türlerine rastlanılmıştır. Sonuç: Giresun ilindeki akarsuların günlük ihtiyaçlarda ve tarım amaçlı sulamada kullanıldığı saptanmıştır. Çalışmanın yapıldığı bölgede atık su arıtım tesislerinin yetersizliği göz önüne alındığında parazit hastalıkları konusunda insanlarda ve hayvanlardaki epidemiyolojisinin belirlenmesine yönelik araştırmaların yapılması ve elde edilen sonuçlara göre kontrol programlarının planlanması gerektiği sonucuna varılmıştır. Ulaşılan kaynak bilgilerde Giresun ilinde ki akarsu ve deniz sularında protozoon ve helmintlerin araştırıldığı bir çalışmaya rastlanılmamıştır.