Introducción: La povidona yodada y el peróxido de hidrógeno podrían ser eficaces contra el SARS-CoV-2. Métodos: Estudio observacional de seguimiento prospectivo (EPA-AS) en 88 pacientes (43±17 años, 55% varones) con SARS-CoV-2 en muestras nasofaríngeas (RT-PCR). 31 recibieron enjuagues/gargarismos con povidona yodada cada 8 horas dos días consecutivos, 17 con la misma pauta de peróxido de hidrógeno, y 40 controles sin enjuagues. Se repitió PCR a 3, 11 y 17 días. Resultados: Tras la intervención no hubo diferencias en la carga viral: povidona yodada (4,3±2,7 copias/ml), peróxido de hidrógeno (4,6±2,9 copias/ml; p=0,40), controles (4,4±3,0 copias/ml). El porcentaje de pacientes con 2ª PCR negativa fue 27% povidona yodada, 23% peróxido de hidrógeno y 32% controles; en la 3ª PCR 62%, 54% y 58% respectivamente y en la 4ª PCR, 81%, 75% y 81%. Conclusión: Nuestros resultados no apoyan la utilidad de los enjuagues de estos dos antisépticos en pacientes con COVID-19.