Les communautés bactériennes jouent un rôle important dans le fonctionnement biologique de crustacés, mais on sait peu de choses sur leur diversité, la structure et la dynamique. Cette étude a été menée pour étudier les communautés bactériennes associées à la Diporeia amphipode benthique, un élément important dans la chaîne alimentaire des Grands Lacs qui a été en baisse au cours des trois dernières décennies. Dans cette étude, la combinaison de séquençage du gène de l'ARNr 16S et « terminal restriction fragment length polymorphism » a révélé un total de fragments de 175 et 138 de restriction de la borne (« T-RFs ») dans des échantillons Diporeia après le traitement par les endonucléases HhaI et MspI, respectivement. T-RFs relativement abondantes et les plus répandus étaient affiliés à des genres Flavobacterium et Pseudomonas, et la Betaprotéobactéries de classe. T-RFs affiliés à l'ordre des Rickettsiales ont également été détectés. Une différence significative en présence T-RF et l'abondance ( P = 0,035) a été détectée chez les profils générés pour Diporeia recueillies auprès de quatre sites dans le lac Michigan. La comparaison des profils générés pour les échantillons prélevés Diporeia en deux ans des lacs Supérieur et Michigan a montré un changement significatif dans la diversité pour le lac Supérieur diporeia mais pas du lac Michigan Diporeia. Profils d'un site du lac Michigan contenaient de multiples T-RFs uniques par rapport aux autres profils lac Michigan Diporeia, notamment celui qui représente le genre Methylotenera. Cette étude a généré la liste la plus complète des bactéries associées aux Diporeia et apporte des informations utiles sur le microbiome de Grande Lacs Diporeia qui peuvent aider à révéler les causes possibles du déclin des populations de Diporeia. [ABSTRACT FROM AUTHOR]