An Agent Forgotten in the Diagnosis of Calf Diarrhea: Bovine Noroviruses and Molecular Characterization.
- Resource Type
- Article
- Authors
- TİMURKAN, Mehmet Özkan; AYDIN, Hakan
- Source
- Veterinary Sciences & Practices. Dec2023, Vol. 18 Issue 3, p102-106. 5p.
- Subject
- *DIAGNOSIS of diseases in calves
*DIARRHEA in animals
*NOROVIRUSES
*ALGORITHMS
*REVERSE transcriptase polymerase chain reaction
- Language
- ISSN
- 2822-3608
İshal algoritması içerisinde virusların rolü oldukça önemlidir. Ayrıca buzağılar için; ishallere bağlı kayıplar oldukça fazla olmakta ve hızlı bir etiyolojik teşhis yapılamadığı durumlarda sürü kontrolü ve korunması gerçe kleşt irile memek tedir. Buzağılarda enterik hastalıkların ana viral etiyolojik ajanlarından olan grup A rotaviruslar ve coronaviruslar bu enfeksiyonlarda sıklıkla tespit edilmektedir. Ancak tekli veya miks enfeksiyonlarda başka etkenlerin varlığı/yaygınlığı da güncelliğini korumakta ve araştırılmaktadır. Genetik olarak farklı iki sığır enterik calicivirusu bilinmektedir: Bunlar genetik olarak insan norovirusları ile ilişkili olan genogrup III norovirusları (NoVsGIII) ve yeni bir calicivirus cinsini temsil eden neboviruslardır. Bu çalışmada buzağılarda ishal paradigması içerinde norovirusların [bovine norovirus (BNoV)] rolü ve genotiplerinin aydınlatılması amaçlanmıştır. Norovirus varlığı ve genogruplarını belirlemek için ishalli buzağılardan toplam 92 adet dışkı örneği çalışmaya dahil edildi. BNoV spesifik nested primerleri kullanılarak RT-nested-PCR gerçekleştirildi. Polymerase chain reaction sonucu 3 örnekte (3/92, %3.2) pozitiflik tespit edildi ve sekans analizine tabi tutuldu. Biyoinformatik analiz sonuçlarına göre son literatürler ışığında noroviruslar 7 ana genogruba ayrılmaktadır. Bu genogruplar içerisinde de sığır norovirusları genogrup III (GIII) içinde yer almıştır. GIII içerisinde ayrıca alt tipler bulunmaktadır. Çalışmamızda tespit edilen 3 suştan 2'si GIII-2a (TR/ERZ/25 ve TR/ELZ/23) ve 1 suş GIII-2b (TR/ERZ/9) içerisinde gruplanmıştır. Noroviruslar üzerine daha kapsamlı moleküler prevalans çalışması yapılarak yaygınlığının ortaya konulması ve mücadele için geliştirilecek aşı çalışmalarında, tespit edilen genogruplar üzerine yoğunlaşılarak; patogenez ve klinik tablo üzerine etkilerinin ortaya konulması gerekmektedir. Dünyada ve ülkemizde genogrup tip profillerinin belirlenmesi ve eğer aşılar geliştirilebilirse koruyuculuk üzerine farklı genogrup çeşitlerinin aydınlatılması, ishal ve norovirus ikileminde fayda sağlayacaktır. [ABSTRACT FROM AUTHOR]