目的·利用生物信息学和免疫组织化学法探究在肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma, LUSC) 组织中香叶 基香叶基焦磷酸合成酶(geranylgeranyl diphosphate synthase 1, GGPS1) 的表达及其临床意义。方法·首先从UCSC Xena 平台下载LUSC组织与配对正常组织的转录组数据, 使用R语言进行数据标准化和差异表达分析, 并利用UALCAN数据库 进行验证;采用UALCAN 和LinkedOmics 数据库分析LUSC 患者中GGPS1 表达与临床病理特征关系;利用Kaplan-Meier Plotter 数据库探究LUSC 患者GGPS1 表达对预后的影响。应用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator, LASSO) 回归分析筛选基因相关系数及风险评分。通过列线图和校正曲线评价GGPS1 对LUSC的诊断价 值。采用STRING、GeneMANIA数据库构建GGPS1 蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI) 网络。运用R 语言 挑选与GGPS1 相关差异基因, 并进行基因本体论(Gene Ontology, GO) 和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG) 富集分析。采用免疫组织化学法检测LUSC患者GGPS1 表达情况, 并分析其 与临床病理特征和预后的相关性。结果·通过TIMER2.0 数据库检索到GGPS1 在多数肿瘤中表达均升高, 且在LUSC中呈 高表达。UCSC Xena、UALCAN数据库中GGPS1 在LUSC的表达高于癌旁组织(均P<0.05)。UALCAN和LinkedOmics 数 据库发现GGPS1 在指标分期较晚患者中的表达水平更高, 且Kaplan-Meier Plotter 数据库显示LUSC患者GGPS1 高表达总生 存期(overall survival, OS) 较短(P<0.05)。基于LASSO回归评估LUSC患者有较好的风险预测效能。构建LUSC患者的 个体化预测模型具有最佳预测准确度。GO、KEGG结果显示, GGPS1 相关基因主要与蛋白质代谢、调节脂质和胆固醇代 谢过程、尼古丁成瘾、磷脂酰肌醇3 激酶(phosphatidylinositol3-kinase, PI3K)/蛋白激酶B (protein kinase B, AKT)/哺乳 动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin, mTOR)、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferatoractivated receptors, PPAR) 信号通路等有关。GGPS1 的代谢功能可能促进肿瘤发生。免疫组化结果提示GGPS1 主要定位于 细胞质中, 且LUSC组织中表达高于癌旁组织(P<0.05), GGPS1 高表达与LUSC患者肿瘤大小、淋巴结转移和TNM分期 有关(均P<0.05), 且GGPS1 表达高的患者OS 明显短于低表达者(P=0.000)。多因素Cox 回归分析提示GGPS1 可作为 LUSC的独立预后因素。结论·相较于正常肺组织, GGPS1 在LUSC中表达显著升高, 尤其在肿瘤体积较大、淋巴结转移 阳性及晚期的患者中表达升高更明显;且GGPS1 过表达是LUSC患者预后差的独立预测因子。GGPS1 有望成为新的LUSC 诊治和预防的分子靶点. [ABSTRACT FROM AUTHOR]