中国辣椒 AAT 基因家族的鉴定及表达分析.
- Resource Type
- Article
- Authors
- 衡 周; 叶 楚; 方健敏; 杨 静; 徐小万; 徐晓美; 李 涛; 王恒明
- Source
- Guangdong Agricultural Sciences. Nov2023, Vol. 50 Issue 11, p40-49. 10p.
- Subject
- *GENE expression
*ACYL coenzyme A
*PEPPERS
*BIOINFORMATICS
*GENES
- Language
- Chinese
- ISSN
- 1004-874X
【目的】中国辣椒(Capsicum chinense)是辣椒主要栽培种之一,种内多数品种的果实呈现由支 链酯类物质形成的浓郁果香。醇酰基转移酶(Alcohol acyl-CoA transferase,AAT)催化支链酯类合成的最后一步 反应,对支链酯类含量有重要影响。鉴定中国辣椒中 AAT 基因家族成员并分析其组织表达模式,可为其功能研 究提供参考。【方法】通过生物信息学分析和实时荧光定量 PCR 对中国辣椒的 AAT 基因家族进行鉴定及表达特 征分析。【结果】从中国辣椒基因组中鉴定到 10 个 AAT 基因,分布于 6 条染色体上,分别命名为 CcAAT1-10。 理化性质预测结果显示,AAT 基因家族编码的氨基酸序列长度在 256~683 aa 之间,分子质量范围为 29~77 kDa, 等电点范围为 5.34~8.79,平均亲水系数均为负值,不稳定指数在 23.76~51.02 之间。蛋白质结构预测显示, CcAAT 的二级结构以 α- 螺旋和无规则卷曲为主,三级结构差异较大。亚细胞定位预测发现 CcAAT 均定位于细 胞质中,其基因启动子上存在 16 种顺式调控元件。时空表达分析显示,CcAAT5、CcAAT6 在辣椒各器官中均未 检测到表达,CcAAT8 在花和果实中特异表达,CcAAT1、CcAAT3、CcAAT7 在叶片中高表达,CcAAT4 在根系中 高表达。【结论】明确了中国辣椒中 AAT 基因家族成员和表达模式,推测 CcAAT8 可能是影响果实支链酯类物 质含量的关键基因。 [ABSTRACT FROM AUTHOR]