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1 . Academic Journal
Pangenome graphs in infectious disease: a comprehensive genetic variation analysis of Neisseria meningitidis leveraging Oxford Nanopore long reads
저자
by
Zuyu Yang
;
Andrea Guarracino
;
Patrick J. Biggs
;
Michael A. Black
;
Nuzla Ismail
, et al.
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Frontiers in Genetics, Vol 14 (2023)
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7 . Academic Journal
A spectrum of free software tools for processing the VCF variant call format: vcflib, bio-vcf, cyvcf2, hts-nim and slivar.
저자
by
Erik Garrison
;
Zev N Kronenberg
;
Eric T Dawson
;
Brent S Pedersen
;
Pjotr Prins
.
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PLoS Computational Biology, Vol 18, Iss 5, p e1009123 (2022)
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RefWorks
7 . Academic Journal
Landscape and selection of vaccine epitopes in SARS-CoV-2
저자
by
Christof C. Smith
;
Kelly S. Olsen
;
Kaylee M. Gentry
;
Maria Sambade
;
Wolfgang Beck
, et al.
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Genome Medicine, Vol 13, Iss 1, Pp 1-23 (2021)
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7 . Academic Journal
A diploid assembly-based benchmark for variants in the major histocompatibility complex
저자
by
Chen-Shan Chin
;
Justin Wagner
;
Qiandong Zeng
;
Erik Garrison
;
Shilpa Garg
, et al.
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Nature Communications, Vol 11, Iss 1, Pp 1-9 (2020)
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7 . Academic Journal
Removing reference bias and improving indel calling in ancient DNA data analysis by mapping to a sequence variation graph
저자
by
Rui Martiniano
;
Erik Garrison
;
Eppie R. Jones
;
Andrea Manica
;
Richard Durbin
.
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Genome Biology, Vol 21, Iss 1, Pp 1-18 (2020)
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7 . Academic Journal
GRAFIMO: Variant and haplotype aware motif scanning on pangenome graphs.
저자
by
Manuel Tognon
;
Vincenzo Bonnici
;
Erik Garrison
;
Rosalba Giugno
;
Luca Pinello
.
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PLoS Computational Biology, Vol 17, Iss 9, p e1009444 (2021)
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7 . Academic Journal
A strategy for building and using a human reference pangenome [version 2; peer review: 2 approved]
저자
by
Bastien Llamas
;
Giuseppe Narzisi
;
Valerie Schneider
;
Peter A. Audano
;
Evan Biederstedt
, et al.
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F1000Research, Vol 8 (2021)
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RefWorks
7 . Academic Journal
Genotyping structural variants in pangenome graphs using the vg toolkit
저자
by
Glenn Hickey
;
David Heller
;
Jean Monlong
;
Jonas A. Sibbesen
;
Jouni Sirén
, et al.
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Genome Biology, Vol 21, Iss 1, Pp 1-17 (2020)
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RefWorks
7 . Academic Journal
Viral coinfection analysis using a MinHash toolkit
저자
by
Eric T. Dawson
;
Sarah Wagner
;
David Roberson
;
Meredith Yeager
;
Joseph Boland
, et al.
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BMC Bioinformatics, Vol 20, Iss 1, Pp 1-10 (2019)
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RefWorks
7 . Academic Journal
478 Translation of a therapeutic neoantigen vaccine workflow to SARS-CoV-2 vaccine development
저자
by
Benjamin Vincent
;
Timothy O’Donnell
;
Maria Sambade
;
Julia Kodysh
;
Steven Vensko
, et al.
소스
Journal for ImmunoTherapy of Cancer, Vol 8, Iss Suppl 3 (2020)
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